Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF17

SH3TC2, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC2Q8TF17 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3TC2Q8TF17 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3TC2Q8TF17 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms