Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHDC4Q8TBB5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KLHDC4Q8TBB5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms