Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST2Q8NFU1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BEST2Q8NFU1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEST2Q8NFU1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms