Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF397Q8NF99 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF397Q8NF99 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms