Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPATA4Q8NEY3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA4Q8NEY3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA4Q8NEY3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms