Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHDC9Q8NEP7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHDC9Q8NEP7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms