Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND90

PNMA1, Paraneoplastic antigen Ma1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA1Q8ND90 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA1Q8ND90 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA1Q8ND90 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PNMA1Q8ND90 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PNMA1Q8ND90 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PNMA1Q8ND90 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms