Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND25

ZNRF1, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF1Q8ND25 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNRF1Q8ND25 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNRF1Q8ND25 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms