Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC44

RETREG2, Reticulophagy regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG2Q8NC44 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RETREG2Q8NC44 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETREG2Q8NC44 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms