Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM229BQ8NBD8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms