Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC89Q8N998 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC89Q8N998 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC89Q8N998 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms