Protein–RNA interactions for Protein: Q8N350

CBARP, Voltage-dependent calcium channel beta subunit-associated regulatory protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBARPQ8N350 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBARPQ8N350 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CBARPQ8N350 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBARPQ8N350 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBARPQ8N350 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBARPQ8N350 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBARPQ8N350 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBARPQ8N350 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBARPQ8N350 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBARPQ8N350 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBARPQ8N350 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBARPQ8N350 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBARPQ8N350 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBARPQ8N350 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBARPQ8N350 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBARPQ8N350 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBARPQ8N350 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBARPQ8N350 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBARPQ8N350 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBARPQ8N350 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBARPQ8N350 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBARPQ8N350 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms