Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN12Q8IYM2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLFN12Q8IYM2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms