Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLF2Q8IX21 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLF2Q8IX21 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms