Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HERC6Q8IVU3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HERC6Q8IVU3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms