Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB11FIP4Q86YS3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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