Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU7

SETD3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD3Q86TU7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SETD3Q86TU7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SETD3Q86TU7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms