Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6J0

SH3RF1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, humanhuman

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF1Q7Z6J0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3RF1Q7Z6J0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
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SH3RF1Q7Z6J0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3RF1Q7Z6J0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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