Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMC4Q7Z404 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMC4Q7Z404 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMC4Q7Z404 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms