Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT25Q7Z3Z0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT25Q7Z3Z0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms