Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNA2D4Q7Z3S7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA2D4Q7Z3S7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms