Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTOP2Q7RTS6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms