Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC80Q76M96 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC80Q76M96 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms