Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BEND4Q6ZU67 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BEND4Q6ZU67 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms