Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC55Q6ZSA7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms