Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf47Q6ZRZ4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms