Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF493Q6ZR52 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF493Q6ZR52 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF493Q6ZR52 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF493Q6ZR52 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF493Q6ZR52 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF493Q6ZR52 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF493Q6ZR52 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF493Q6ZR52 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF493Q6ZR52 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF493Q6ZR52 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF493Q6ZR52 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF493Q6ZR52 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF493Q6ZR52 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF493Q6ZR52 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF493Q6ZR52 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF493Q6ZR52 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms