Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C16orf54Q6UWD8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C16orf54Q6UWD8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms