Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARM1Q6SZW1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARM1Q6SZW1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARM1Q6SZW1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARM1Q6SZW1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARM1Q6SZW1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARM1Q6SZW1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARM1Q6SZW1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARM1Q6SZW1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARM1Q6SZW1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SARM1Q6SZW1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARM1Q6SZW1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARM1Q6SZW1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SARM1Q6SZW1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SARM1Q6SZW1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms