Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC174Q6PII3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC174Q6PII3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC174Q6PII3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms