Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CTR9Q6PD62 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms