Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RHBDD2Q6NTF9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RHBDD2Q6NTF9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms