Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRNIPQ6NTE8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms