Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TXNDC8Q6A555 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TXNDC8Q6A555 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms