Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDHAF4Q5VUM1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDHAF4Q5VUM1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms