Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
EFCAB2Q5VUJ9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
EFCAB2Q5VUJ9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
EFCAB2Q5VUJ9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
EFCAB2Q5VUJ9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
EFCAB2Q5VUJ9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
EFCAB2Q5VUJ9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
EFCAB2Q5VUJ9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
EFCAB2Q5VUJ9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
EFCAB2Q5VUJ9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
EFCAB2Q5VUJ9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
EFCAB2Q5VUJ9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
EFCAB2Q5VUJ9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
EFCAB2Q5VUJ9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
EFCAB2Q5VUJ9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
EFCAB2Q5VUJ9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
EFCAB2Q5VUJ9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
EFCAB2Q5VUJ9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
EFCAB2Q5VUJ9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
EFCAB2Q5VUJ9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms