Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE4DIPQ5VU43 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DIPQ5VU43 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms