Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GKAP1Q5VSY0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GKAP1Q5VSY0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms