Protein–RNA interactions for Protein: Q5T870

PRR9, Proline-rich protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR9Q5T870 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRR9Q5T870 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRR9Q5T870 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRR9Q5T870 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRR9Q5T870 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRR9Q5T870 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRR9Q5T870 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRR9Q5T870 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms