Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAPCD1Q5SSQ6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAPCD1Q5SSQ6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms