Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB41Q5JT25 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB41Q5JT25 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms