Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITRM1Q5JRX3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms