Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC178Q5BJE1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms