Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTXN3Q4LDR2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms