Protein–RNA interactions for Protein: Q401N2

ZACN, Zinc-activated ligand-gated ion channel, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZACNQ401N2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZACNQ401N2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZACNQ401N2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms