Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
KRTAP21-1Q3LI58 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms