Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NDUFAF6Q330K2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms