Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ISXQ2M1V0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ISXQ2M1V0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms