Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKIDA1Q1XH10 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIDA1Q1XH10 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
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