Protein–RNA interactions for Protein: Q1L5Z9

LONRF2, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF2Q1L5Z9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LONRF2Q1L5Z9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LONRF2Q1L5Z9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF2Q1L5Z9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF2Q1L5Z9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF2Q1L5Z9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF2Q1L5Z9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF2Q1L5Z9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF2Q1L5Z9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LONRF2Q1L5Z9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF2Q1L5Z9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF2Q1L5Z9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF2Q1L5Z9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF2Q1L5Z9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LONRF2Q1L5Z9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF2Q1L5Z9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LONRF2Q1L5Z9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms